方舟做為避難載具上的不足，只是聖經正統教義派人士恐懼的理由之一。另一個讓他們寢食難安的原因，是方舟停泊在一處山峰的峰頂。雖然聖經上並沒有註明那座山峰的地圖座標，但傳統上認為就是東土耳其的阿勒山（Mount Ararat）。諾亞的動物們在阿勒山上岸，引發了為何與世界動物區系分佈不相合的問題。如果說所有在大洪水之後倖存的動物都在阿勒山登陸，那麼這些為數眾多的物種如何到達牠們該去的住所？
以最簡單的層面來看，這是散佈的問題。
不會飛的美洲鴕，如何從土耳其遠渡重洋到達南美洲？用走的嗎？北極熊要回到北極，沿途的環境如何提供適合北極熊的低溫、冰洋和美味的海豹？對北極熊而言，想要越過高加索山脈，真是一條漫長、炎熱、饑餓的歸鄉路啊！還有，煩人的袋鼠又如何回到澳洲？這些該死的傢伙到底能不能一路跳那麼遠？
進一步來看，還包含動物分佈模式不連續的問題。
假設袋鼠能從阿勒山一路跳回澳洲，為什麼牠們不會在亞洲徘徊或停留？倘若葵花鸚鵡一出諾亞方舟後，便向東南方飛，為何會一路飛抵龍目島？為何牠們對途經之地嗤之以鼻？其中最令人困惑不解的是峇里島，種種條件都與龍目島極為相近，為什麼就不能雀屏中選？
林奈與阿勒山傳說
第一個看穿阿勒山和方舟傳說與生物事實間相衝突的是林奈。他懷疑即使諾亞再怎麼調整肘呎的大小，就這麼一條船，真能夠讓船上的每對動物都能各得其所和各適其所？林奈也對獲救的動物在一座山上登陸的說法，抱持懷疑的態度。
不同於前述拘泥於字義的學者，林奈改由抽象的意涵來說明阿勒山傳說。他認為阿勒山所指的是那座孕育萬物、而萬物由之向四方分佈的太初之島：如果回溯到地球初始時，我們有證據相信當時陸地的分佈，不像今日的廣闊而支離。那時候，只有一個小島在海平面之上。
依林奈之意，這座島就是上帝創造萬物的殿堂伊甸園，是生命的博物館，長滿在今日世界活躍著的各式各樣動物和植物。這是一座山型島。島上因海拔不同而分出不同的氣候區：山底是熱帶氣候區，山腰是溫帶氣候區，山頂周邊屬於寒帶氣候。島上每一種動物在一定的海拔，有牠們賴以生存的適當土壤和適當氣候。
當太古時代的海水退去，露出海平面的陸地與日俱增，散佈在地球各處的不同氣候之土地面積增加，適合那些氣候區的動物也隨之擴大生活版圖。氣候條件決定那些動物在該氣候區的土地上生活；而那些膺選的動物，其生理狀況對所處的氣候條件也能適應良好。因此，不同氣候區內各有其特殊的動物區系，這是恆久不變的。
林奈的見解引致兩種截然不同的結果：其一部份有助於真理之浮現他所提的適當土壤和適當氣候的口吻，乍聽起來與生態學上之物種適應於其區位，這個在一段時日之後方才發展的觀念相類似；另一部份則是治絲益棼林奈所云，動物和其棲息地間的適當（proper）關係是永遠不變的，這段話把一些十八世紀的研究者，誘入量身打造（special creation）的錯誤陷阱中。
量身打造這個觀念，意指上帝參與了物種源起的各項細節。如此一來便能掃清那些為圓方舟傳說之字義解釋而產生的謬論（如小肘呎對大肘呎），讓諾亞的大洪水故事，以非字義的寓言型式再度為人所接受。
按照量身打造的觀念，沒有被寫成寓言故事的，就是上帝在創造萬物上的直接角色，這點還是堅守著字義和歷史的窠臼，只是此一觀念下的上帝恐怕要比以前忙多了。
在量身打造的觀念下，上帝所扮演的不只是全能的創造者，也兼顧引領動物的工作。祂會視地方的特性，打造出適合在那兒生長的動物，並護送牠們到達目的地。以這樣的方式，上帝創造出適合在北極生存的北極熊，而北極就是這些熊的家；祂雕塑出袋鼠，正確地放在屬於牠們的澳洲；祂讓水豚能適應南美沼澤地的生活。祂把注意力分散在幾個不同的地理區，而每個地理區就是一個創造生命的大本營。
因此，祂所創造的所有植物區系、動物區系和整個群落裏的每一個成員，都能與當地的地文背景相契合，現下成熟的生態系就此應運而生。上帝說讓那兒成為新熱帶雨林，瞧！雨林就出現在那裏了；祂要那兒有硬葉植物灌木叢，果真就長出來了；祂說那兒要有針葉林，林中滿是成群的有角有蹄類哺乳動物徜徉著，還有耐寒的捕食者在找尋獵物。當盛夏來臨，野花匆匆地綻放，小型哺乳動物便如戲劇般快速繁衍，而蚊子的數目更是不可勝數等等。
這位十八世紀的人所想像的上帝，是一位事必躬親不懂得授權的傢伙。量身打造徹頭徹尾以實體論來解析動物源起，以及散播成現在的動物分佈模示。這個觀念看似解決所有問題，事實上是什麼問題都沒解決。然而，這種源於誤解而非欺騙的觀念成為新的基督教義，主宰社會思維相當長的時間，直到達爾文和華萊士挺身挑戰它。
學子們遊歷星球
同時林奈也展現了他的另一個影響力他在烏普薩拉（Uppsala）任教，培育、影響了不少英才．所教導的學生中有許多日後都成了科學探險家，依循他們老師睿智的計畫，一步步遊歷這個星球的各角落，研究當地的各種生物。
林奈之門生中，歐思貝（Osbeck ）遠揚到中國；索藍德（Solander）隨庫克船長和邦克斯雲遊四海；蓋林（Gmelin）的足跡則達西伯利亞；山博（Carl Ppeter Thunberg）深入日本帝國，隨後刊行《日本植物誌》（Flora Japanica）一書。
這本《日本植物誌》可算是一本島嶼生物地理學的書。當時這些生物學者之所以能與其前輩，如彼格菲塔、康堤、哥倫布等有所不同而自成一派，在於山博和其同儕們是為了企圖提出說明而進行這些探險，他們在過程中用心觀察、蒐集相關的生物地理事實，不同於前輩們只是在探險時無意中發現。
《日本植物誌》只是他們這個派別豐碩的遊歷成果之一。在這之前，林奈的朋友格諾維厄（J.F. Gronovius），就已經將他在維吉尼亞田野工作的成果，寫成《維吉尼亞植物誌》（Flora Virginia）；林奈本人則以其年輕時在拉普蘭（Lapland）地區從事探險旅遊所觀察的結果彙整成《拉普蘭植物誌》（Flora Lapponica）一書；蓋林也因其亞洲植物之旅，方有《西伯利亞植物誌》（Flora Sibirica）和《東方植物誌》（Flora Orientalis）兩本書先後付梓。
不知是林奈首開先例（以其烏普薩拉市植物學權威身份），或者還有其他理由，大部份十八世紀的生物學者，都把心力貫注在植物物種鑑定與分佈圖上，動物方面的研究工作則乏人問津。在十八世紀的植物研究澎湃浪潮下，成就了大量的植物學文獻。其中有亞奎（Von Jacquin ）的《奧地利植物誌》（Flora Austriacae）、萊福（Lightfoot）的《蘇格蘭植物誌》（Flora Scotica）、歐德（Oder）的《丹麥植物誌》（Flora Damicae）以及特立獨行的魏士頓（Richard Weston），不隨波附和所謂的科學拉丁文，於一七七五年以英文寫成《英國植物誌》（English Flora）。
《英國植物誌》出刊的四年前，也就是一七七一年，一個引人注目的傢伙佛斯特（Johann Reinhold Foster）突破了人所未見的北美蠻荒，寫成《北美植物誌》（Flora Americae Septentrionalis）。八年後，當華萊士幽居在沙撈越等待雨季結束，沉思那些從未有人正確利用的大量資料時，上面所列的一些書，就是他腦海中的一部份。
佛斯特所撰的《北美植物誌》與當時類似的著作相較，可算是相當經得起時間考驗、歷久彌新的好書。生於普魯士的佛斯特，為繼承父親的衣缽而受過牧師訓練，但他本人志不在此，反而熱中研究自然的歷史。有幾年時間，他在但澤市（Danzig）附近擔任牧師，但小池子終究留不住騰雲的蛟龍。
一七六五年，他到俄羅斯一遊，開了眼界。翌年，他為了讓自己成為一位學者而移民英國。佛斯特與華萊士一樣，都屬於那種有縫就鑽、能及時掌握機會的爬藤型人物。在一七七〇年，他所著的《大英昆蟲索引》（Catalogue of British Insects）便已問世。有一段時間，他在蘭開夏郡（Lancashire）著名的新教徒學院裏教語文和自然史。
佛斯特遊南半球
佛斯特還因編譯坎姆（Kalm）、歐思貝和其他旅行家及自己的著作而名噪一時，一七七二年他獲選為皇家學會（Royal Society）的成員，稍後又蒙幸運之神的眷顧，取代了邦克斯，成為庫克船長第二次出航探險的隨船博物學家。
這趟航程一走就是三年。在這段時間裏，佛斯特遊歷了南半球，見識了許多壯觀的生物地區。只是，佛斯特畢竟兼有普魯士人和分類學家認真又乏味的個性，少了邦克斯那種隨和、愛好玩樂的相處魅力，他不僅難與水手們打成一片，連庫克船長最後也對他頗為感冒。因此，就他個人而言，這是一趟不快的旅程。
一位歷史學者以一個既惹人厭、又找麻煩的正經八百學究，來形容佛斯特；另一位更是有欠公允地訕笑佛斯特的科學撰述過於紛雜。
在那幾週沿著南極冰棚邊緣航行的險惡探險，與返回大溪地休養喘息兼補充必需品的交替航程，對一個循規蹈矩的人，日子想必是極難熬的。當船停泊在大溪地，庫克船長的手下，竟以紅鸚鵡的羽毛就和當地女子們發生性交易，佛斯特實在看不過去，便把觀感說了出來。然而，他的道德觀卻引來以下的回報。
對這位令人不快的伙伴，庫克船長心中早已深感不悅，於是回到英國後，便力請英國海軍總部禁止佛斯特出版著作，而他自己則獨家發表此行見聞。
佛斯特之子不甘示弱，於是挺身遊走於禁令邊緣，以代言人的身份，出版了佛斯特在這趟環球之旅的發現。最後，佛斯特本人也顧不得禁令，著成《環球航海觀察論地理、自然史和道德哲學》（Observations Made During a Voyage Round the World, on Physical Geography, Natural History, and Ethic Philosophy）一書付梓。先不管佛斯特的道德哲學有何意指︱有一點可以確定的是，大溪地的那檔事並未收錄其中。
物種與區域間的祕密
在那個時代，如果沒有一些特定島嶼做為中繼站，以補充生活上的必需品，是不可能完成環球壯舉的。在那些中繼站裏，庫克船長對紐西蘭和大溪地特別青睞。
而同樣基於後勤補給的理由，亞速爾群島（Azore）、馬德拉群島（Madeira）、加那利群島（Canarie ）、馬斯克林群島（Mascarene）等島群，也漸漸為歐洲水手所熟知（因此也為歐洲科學界所熟知），這些島群各在某些航道的必經之地。另外，塔斯馬尼亞島、克圭倫島和夏威夷群島上的動物區系，也逐漸受到人們的注意。
航海的探險家和隨行的博物學家，能夠接觸到那些偏遠島嶼的獨特物種，因此與陸地上的旱鴨子相較，有較多機會目睹生物學上的奇蹟，即使是遊遍歐亞的早鴨子也不例外。而佛斯特算是那個時代有航海經驗的博物學家中，獨具慧眼的一位他注意到一個似乎是顯而易見、極具重要性，卻為人所忽略的事實。佛斯特寫道：
島嶼上物種數目的多寡，與島嶼之幅員大小成正相關。
與小島相較，大島有較大的多樣性。就這樣，佛斯特碰觸到物種與面積間的關係。以此為出發點，歷經兩階段的邏輯推演和兩百年的時光，人們方才洞悉生態系衰減的問題。